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1. chinaXiv:202104.00023 [pdf]

动脉粥样硬化ApoE-/-小鼠模型尿液蛋白质组学变化探究

华元瑞; 孟文书; 魏静; 刘永涛; 高友鹤
Subjects: Biology >> Biochemistry

心血管疾病是当今世界第一大致死因素,动脉粥样硬化是其重要病理基础,其早期诊断具有重要意义。尿液更利于积累和反应机体生理状态的变化且不受到稳态机制的调节,是疾病早期生物标志物的良好来源。本文通过高脂饮食诱导ApoE-/-小鼠5个月构建动脉粥样硬化动物模型,选取七个时间点收集实验组及正常饮食对照组c57BL/6小鼠尿液样品,使用蛋白质组学分析方法,进行自身对照和组间对照。自身对照结果表明高脂饮食1周前后尿液蛋白质组差异显著,同时多种差异蛋白被报道过与动脉粥样硬化相关或可作为其生物标志物。组间对照结果表明差异蛋白GO分析得出的生物学过程能够对应疾病发生发展的进程。两种对照方式得到的差异性化学修饰也多被报道与该疾病进程相关。实验证明了尿液蛋白质组学有敏锐监测机体变化的潜力,为寻找动脉粥样硬化早期生物标志物提供了可能。

submitted time 2021-04-08 Hits84Downloads33 Comment 0

2. chinaXiv:202002.00085 [pdf]

晚期肺癌患者药物治疗前后尿蛋白质组的变化

张亚萌; 衡姊琦; 魏静; 王颖轶; 高友鹤
Subjects: Biology >> Biochemistry

肺癌作为一种严重威胁人类生命健康的疾病,尽管治疗方法种类较多,但如何把握治疗时机,为患者确定最有效的治疗用药仍然是一个难题。尿液蛋白质组可以敏感的反映机体的生理变化,有希望反映药物治疗后机体的病理或生理变化。为了研究晚期肺癌患者使用不同的药物进行治疗时其尿液蛋白质组的变化情况,通过收集晚期肺癌患者治疗前后的不同时间的尿液样本,使用液相色谱联用质谱(LC-MS / MS)来检测其尿蛋白组的变化。比较结果发现,当不同的患者使用不同药物治疗后,差异蛋白的变化各不相同,其差异蛋白反映的生物学过程变化和患者的临床表现变化较为一致。这项研究结果表明,(1)能够通过尿蛋白的变化反映不同药物治疗后患者的病理生理变化;(2)当不同患者使用相同药物治疗后,尿蛋白的变化能够反映出患者体内不同的病理生理变化,且和患者的临床病情评估结果较为一致。这些发现有可能为辅助临床治疗提供重要信息。

submitted time 2020-02-28 Hits7125Downloads1356 Comment 0

3. chinaXiv:201711.01259 [pdf]

个体视角下的网络舆情传递链路预测分析

魏静; 朱恒民; 宋瑞晓; 蒋世兵
Subjects: Library Science,Information Science >> Information Science

【目的】通过网络舆情传播中网民个体的“从众效应”和“阈值效应”的传递特点分析, 对舆情传递的链路结构进行预测。【方法】采集真实网络舆情传递在线数据, 利用舆情传递个体的节点属性及舆情传递网络结构的已知信息, 使用链路预测方法, 分别针对网络舆情无标度(BA)网络模拟数据和真实舆情传递网络数据, 预测已有节点间即将产生的舆情传递连接。【结果】通过网络数据仿真和BBS 真实数据链路预测分析发现, 在众多的链路预测相似性指标中, 局部路径指标(LP)算法得出的链路预测结论正确率最高, 说明LP 算法适合此类舆情传递网络的链路预测分析。【局限】仅限于对已有链路预测相似性指标的应用, 没有对传统链路预测相似性指标进行相应的改进。【结论】从数据角度提供一个有效的预测舆情发展趋势的分析方法, 以期为网络舆情控制提供相关理论支持。

submitted time 2017-10-11 From cooperative journals:《数据分析与知识发现》 Hits1037Downloads690 Comment 0

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