不同粗饲料条件下梅花鹿瘤胃甲烷菌结构的比较分析

分类： 生物学 >> 动物学 提交时间： 2017-10-11 合作期刊: 《动物营养学报》

李志鹏 刘晗璐 司华哲 鲍坤 李光玉

摘要： 本研究旨在基于高通量测序技术分析比较采食3种常见粗饲料梅花鹿瘤胃甲烷菌结构。选取3只2岁龄的装有永久性瘤胃瘘管的成年雄性梅花鹿为研究对象，采用3×3拉丁方设计，分别饲喂以柞树叶（OL组）、玉米秸秆（CS组）和玉米青贮（CI组）为主要粗饲料的饲粮。预试期1周，正试期为4周。采用引物A519F、A976R扩增瘤胃甲烷菌16S rRNA基因V3～V4区，基于Illumina Miseq PE250平台进行测序。结果表明：9个样本共获得600 352条高质量的甲烷菌16S rRNA基因序列，基于97%相似性共归为111个分类操作单元（OTU）。覆盖度指数（Good’s overage）表明本试验样品覆盖了瘤胃99%的甲烷菌。分类分析结果表明Methanobrevibacter spp.[OL组：（97.80±6.00）%；CS组：（97.10±1.50）%；CI组：（87.50±5.50）%]是梅花鹿瘤胃优势甲烷菌，但采食3种粗饲料梅花鹿瘤胃甲烷菌在种水平的分布有差异。CI组Methanosphaera stadtmanae相对丰度显著高于OL组与CS组（P0.05），OL组与CS组Methanobrevibacter boviskoreani丰度高于CI组（P>0.05），而CS组与CI组Methanobrevibacter olleyae相对丰度高于OL组（P>0.05）。本研究发现Methanobrevibacter spp.是梅花鹿瘤胃优势甲烷菌。

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