基于高通量测定肉鸡回肠微生物多样性及PICRUSt基因预测分析

分类： 生物学 >> 动物学 提交时间： 2017-10-11 合作期刊: 《动物营养学报》

徐帅 林奕岑 周梦佳 倪学勤 曾东 曾燕

摘要： 本试验旨在研究健康肉鸡回肠的微生物群落结构及功能。采用高通量测序技术对15只鸡的回肠内容物进行测序，按照97%的相似度归类OTUs，去除序列数量少的OTUs（n＜2），然后进行生物信息学分析及PICRUSt基因预测。结果表明：1）共获得424 062条tags，并归类于1 002个非单OTUs，样品平均tags为（28 271±8 855）条，平均OTUs为（261±82）个。2）所有样品共含有20个菌门，160个菌属。其中，共享核心菌门4个，分别是厚壁菌门（85.35%）、变形菌门（6.09%）、蓝细菌门（2.15%）和放线菌门（0.16%）。共享核心菌属19个，占样品总微生物总量的93.75%。3）鸡回肠预测得出328个功能。从前20功能热图可知，各样品的效能存在差异。由此可见，鸡回肠微生物群落复杂，但主要菌群相对稳定。本试验为进一步研究鸡回肠微生物群落结构与功能提供参考依据。

 点击量 2193  下载量 1270  评论