METTL16在泛癌中的综合分析：一种潜在的预后和免疫学生物标志物

分类： 医学、药学 >> 基础医学 提交时间： 2022-11-24

黄祝谷 吕紫茵 李志宏 黄树强 谭翠钰 郑锦圳

摘要： [目的] 通过生物信息学方法探讨 METTL16在泛癌中的诊断价值及肿瘤预后评估的作用。 [方法] 从多个相关数据库中获取各个肿瘤及正常组织中的基因数据，分析了METTL16在不同癌症中的表达的表达水平，其中包括癌症细胞系百科全书 （CCLE）、癌症基因组图谱（TCGA）和基因型-组织表达项目（GTEx）。采用Cox回归分析和Kaplan-Meier分析来评估METTL16表达水平高低与肿瘤预后之间的关系。使用肿瘤免疫评估资源 (TIMER) 来评估METTL16与癌症中的免疫细胞浸润的相关性。同时，还分别分析了METTL16的表达水平与常见的免疫调节因子、DNA甲基转移酶（DNMTs）、错配修复（MMRs）、微卫星不稳定性（MSI）和肿瘤突变负荷（TMB）之间的关系。此外，通过基因集富集分析 (GSEA) 来识别癌症中的关键通路。 [结果] METTL16在多种癌症中异常表达，生存分析表明其表达水平与许多癌症患者的临床预后相关。METTL16 的表达水平与结肠癌（COAD）、肾透明细胞癌（KIRC）、肝癌（LIHC） 中的的六种免疫浸润细胞（B细胞、CD4 + T细胞、CD8 + T细胞、树突状细胞、巨噬细胞和中性粒细胞）的表达水平呈正相关。此外，METTL16表达与多种癌症中的免疫检查点基因表达、MMR、DNA 甲基转移酶水平、TMB 和 MSI 显着相关。同时，GSEA 还揭示了METTL16参与了肿瘤和免疫相关信号通路的调控。 [结论] METTL16与肿瘤预后和肿瘤免疫浸润密切相关，并在多种肿瘤的发生发展中起着重要作用。METTL16可能成为一种很有前途的各种肿瘤预后生物标志物，并为未来的肿瘤免疫研究和治疗策略提供新的思路。

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