白菜CesA 基因家族鉴定及表达模式分析

分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2022-02-14 合作期刊: 《广西植物》

马宇辰 赵玉梅 黄丹霖 张梦晴 吴晓宇 王洁 陈雨 黄家保 段巧红

摘要： 为探究 CesA 基因家族在白菜生长发育及纤维素合成过程中的作用机制，该研究通过 生物信息学的方法，以白菜的全基因组序列为研究区域，进行了理化特征、基因结构、进化 特征、保守基序及结构域、顺式作用元件和组织表达等鉴定分析。结果表明:（1）白菜基因 组中鉴定出 16 个编码纤维素合成酶亚基的 CesA 基因，该家族成员所编码蛋白的理论等电 点介于 4.76~9.12，相对分子量 17.76~122.67 kD，长度 153~1 089 aa；（2）其中 15 个基因 不均匀地分布于白菜的 7 条染色体上，Bra036008 定位于 scaffold 上；（3）大部分成员包含 4-14 个外显子，1-11 个保守基序；（4）序列比对显示该家族具有保守的DDD-QXXRW 保 守功能域；（5）该家族编码蛋白主要分布在质膜上，二级结构以无规则卷曲与α-螺旋为主， 多数成员都含有CesA 蛋白典型的N 端、C 端和跨膜区；（6）CesA 基因在茎中表达量相对 较高，其中Bra011865、Bra023952 和Bra029874 在茎、叶、花中显著表达。该研究利用生 物信息学方法对白菜CesA 基因家族进行了全基因组鉴定，为后续深入研究CesA 基因功能 奠定了基础，也为白菜生长发育研究奠定基础。

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