枫香叶片变色期全长转录组测序及分析

摘要: 枫香因其树形优美，入秋后叶色红艳或橙黄，极具观赏价值，是优良的景观生态树种。 为了解枫香叶片变色及其次级代谢过程的遗传基础，该文以枫香 5 个变色期叶片混合样品为 材料，利用单分子实时测序技术（PacBio 平台）对其进行全长转录组测序。结果表明：（1） 全长转录组测序共获得 41.04 Gb 的高质量数据，从中鉴定出全长非嵌合序列 563 180 条，通 过聚类和去冗余，获得 27 269 条高质量全长转录本。在 27 269 条全长转录本中预测到 2 035 条长链非编码 RNA（lncRNA），并检测出 14 892 个简单重复序列（SSR）位点和 1 856 个转 录因子。（2）基因注释结果表明，NR、GO、COG、KEGG 等 8 个数据库共注释了 24 857 条转录本，KEGG 数据库共获得了 124 个条代谢途径，主要有核糖体、碳代谢、氨基酸生物 合成等，在类黄酮和叶绿素代谢途径中分别有 49 和 71 个转录本参与。上述结果初步揭示了 枫香叶片变色期转录组信息以及功能特性，为后续研究枫香叶片变色分子机制、色素代谢合 成途径和调控、相关功能基因克隆以及叶色改良提供基础数据。