基于16SrDNA测序探索食管鳞癌患者肠道菌群特征

摘要: 目的 探索食管鳞状细胞癌患者肠道菌群基本特征。方法 纳入未经任何抗肿瘤治疗的食管鳞状细胞癌患者35例作为食管癌组（EC组），健康志愿者35例作为对照组（DZ组）。收集两组人群粪便标本，应用16S rDNA技术检测肠道菌群，根据检测结果物种注释情况分析两组人群肠道菌群的Alpha多样性、Beta多样性及差异菌群物种。结果 两组人群肠道菌群Alpha多样性香农指数（Shannon）、辛普森指数（Simpson）、Chao1及ACE指数均无明显差异（P<0.05），而Beta多样性主坐标分析图（PCoA）显示两组样本整体上相距较远，物种结构存在差异。差异物种t检验结果显示，在属水平上与DZ相比，EC组中栖粪杆菌属（Faecalibacterium）、罗斯氏菌属（Roseburia）、柠檬酸杆菌（Citrobacter）等丰度降低；罗姆布茨菌(Romboutsia)、瘤胃球菌属组（Ruminococcus_torques_group）、肠杆菌（Intestinibacter）、土杆菌属（Turicibacter）等的丰度升高（P<0.05）。LEfSe分析显示，在属与种水平上与DZ组相比，EC组中栖粪杆菌属（g-faeculibacterium）及普拉梭菌（s-faecalibacterium- prausnitzii)丰度明显降低；罗姆布茨菌（g-Romboutsia）, s-Rombutsia-ilealis丰度明显升高（P<0.05）。结论 食管鳞状细胞癌患者具有显著性差异肠菌，其中栖粪杆菌属、普拉梭菌、罗姆布茨菌属及Rombutsia-ilealis可能是食管癌特异性改变物种，与食管癌发生密切相关。